Hypoxia-activated scleraxis a mediates epicardial progenitor differentiation into a unique cardiac perivascular cell type
该研究揭示了缺氧通过 Hif1a 信号通路诱导斑马鱼心外膜中 Scleraxis a 表达，进而驱动心外膜祖细胞分化为一种独特的、由 Col18a1a 标记的心血管周细胞（Epi-PMCs），从而在冠状血管发育与心脏再生中发挥关键的血管稳定作用。
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developmental biology
274 篇论文
Conserved roles of GATA4 and its target gene TBX2 in regulation of human cardiogenesis
该研究揭示了转录因子 GATA4 通过直接调控靶基因 TBX2 和 PRDM1 在非洲爪蟾及人类诱导多能干细胞中保守地发挥心脏发育调控作用，阐明了这一基因调控网络在心肌细胞分化、命运决定及功能成熟中的关键机制。
Single-cell-scale spatial transcriptome reveals early regional priming of the developing mouse ovary
该研究利用 Visium HD 空间转录组技术绘制了小鼠卵巢发育的分子蓝图，揭示了一个在胎儿期（E16.5）即出现、包含处于激活预备状态的前颗粒细胞的“髓质核心”新结构域。
Epithelial-Mesenchymal Wnt Crosstalk Directs Planar Cell Polarity in the Developing Cochlea
该研究表明，内耳上皮与间充质来源的 Wnt 信号（如 Wnt5a、Wnt7a 和 Wnt7b）通过高度冗余的机制协同指导耳蜗发育延伸及毛细胞平面细胞极性的建立，单一来源或单一配体的缺失通常不足以引发严重缺陷，而双来源 Wnt 信号的联合缺失则导致耳蜗显著缩短及毛细胞极性丧失。
Estimating mean growth trajectories when measurements are sparse and age is uncertain
该研究提出了一种基于代谢和异速生长原理的贝叶斯因果模型，证明即使面对年龄不确定且数据稀疏（如仅包含 100 名儿童的单次测量）的情况，也能准确估算人群平均生长轨迹，从而为跨时空比较当代与历史人群的生长模式提供了有效工具。
Kindlin-2-Moesin interaction orchestrates sprouting angiogenesis via modulating endothelial membrane mechanics and VEGF signaling
该研究揭示了 Kindlin-2 通过与 Moesin 的 N62 位点相互作用来调控内皮细胞膜张力，进而促进 VEGFR2 内吞及下游信号传导，从而驱动血管生成。
Mitotic bookmarking by Prox1 preserves mammalian neuronal lineage identity memory via promoting timely H3K27me3 restoration
该研究揭示了转录因子 Prox1 通过在有丝分裂期间滞留并促进关键基因上 H3K27me3 修饰的及时恢复，从而作为有丝分裂书签维持小鼠海马神经元谱系身份记忆并防止谱系身份危机的分子机制。
TNAP and PHOSPHO1 function synergistically to afford critical control over the mineralisation of the postnatal murine skeleton
该研究通过构建新型小鼠模型，揭示了组织非特异性碱性磷酸酶（TNAP）与 PHOSPHO1 在出生后骨骼矿化中发挥关键的协同作用，两者同时缺失会导致严重的矿化缺失和骨骼畸形，而单个 TNAP 等位基因的存在则足以挽救双酶缺失引起的矿化障碍。
Notch-driven fate asymmetry dictates hair cell behavior via a fate-specific kinase
该研究利用斑马鱼侧线系统，结合活体成像与单细胞测序技术，揭示了 Notch 信号通过调控命运特异性激酶 stk32a 驱动毛细胞产生相反方向的迁移以确立极性，并发现 stk32a 缺失会暴露出一种超越 Notch 介导的命运决定的潜在手性对称破缺机制。
Spinal cord regeneration deploys adult molecular programs that do not recapitulate embryonic development
该研究通过整合单细胞转录组数据发现，成年斑马鱼脊髓再生并非简单重演胚胎发育过程，而是通过重新利用发育通路来执行新获得的再生功能，且成年损伤反应性祖细胞仅部分重现幼体特征，其背腹轴身份在稳态和再生过程中并未被忠实维持。
A single-cell transcriptomic atlas of inner ear morphogenesis in zebrafish
该研究利用单细胞转录组测序技术构建了斑马鱼内耳发育图谱，揭示了感觉斑、半规管、内淋巴囊等关键结构的细胞状态及其分子特征，并阐明了*lmx1bb*突变导致形态发生缺陷的机制。
Synthetic reconstitution of planar polarity initiation reveals collective migration as a symmetry-breaking cue
该研究通过工程化上皮系统的体外重构发现，集体迁移作为全局线索能打破对称性，通过诱导 CELSR 蛋白在细胞连接处的富集来启动平面细胞极性，且这一过程独立于 VANGL-FZD 相互作用，揭示了从分子到组织尺度协调极性建立的机制。
Angiogenic Signaling Counteracts Shear Stress-driven Arterial Patterning.
该研究发现血管内皮生长因子 A（VEGF）并非诱导动脉分化，而是作为生理性“刹车”抑制流体剪切力驱动的 Sox17 转录活性，从而防止毛细血管过早动脉化，揭示了血管形态发生中促血管生成信号与动脉模式形成之间的拮抗调控机制。
Early development of male germ cell clones shapes their reproductive success
该研究通过非侵入性条形码追踪技术发现，雄性生殖细胞的克隆贡献在胚胎迁移早期即因随机瓶颈效应而高度偏斜并趋于稳定，且成年期的繁殖成功率与胚胎期建立的克隆规模成正比，而精曲小管内的克隆区室化分布则有助于维持克隆多样性并防止优势克隆的过度扩张。
Integrative Inference of Spatially Resolved Cell Lineage Trees using LineageMap
本文介绍了 LineageMap，一种基于统一概率框架的混合算法，能够整合细胞谱系条形码、基因表达谱和空间位置三种模态数据，从而高精度、可扩展地重构细胞谱系树并推断祖先细胞的空间位置。
Unified Transcriptome and Mechanics Map of the Intact Mammalian Preimplantation Embryo In Situ
该研究开发了统一转录组与力学图谱（UTMM）技术，实现了对完整哺乳动物早期胚胎中空间转录组与细胞质刚度的同步原位测量，揭示了细胞命运决定过程中转录状态与力学特性（如细胞软化）的耦合机制及其功能重要性。
HDAC1/2-mediated repression of Wnt receptor expression orients asymmetric division polarity in C. elegans.
该研究揭示了线虫中组蛋白去乙酰化酶 HDA-1 通过抑制 Wnt 受体（LIN-17 和 CAM-1）的表达来维持其沿体轴的梯度分布，从而为不对称细胞分裂的极性定向提供关键的位置线索。
Niche-dependent modular regulation of the stem cell transcriptome separates cell identity and potential
该研究揭示了果蝇雄性生殖系通过两种互补机制（即分化后代继承持久性干细胞mRNA以维持潜能，以及Bmp和Jak-Stat两种微环境信号的组合调控以定义不同细胞身份），成功解决了干细胞潜能与当前身份分离的悖论，从而在维持组织稳态的同时确保受损干细胞的有效再生。
Sharp cell-type boundaries emerge from temporal coordination between morphogen signals
该研究揭示了 Wnt 和 Hedgehog 信号通路通过时间协同调控细胞周期退出与分化进程，从而在毛囊真皮凝聚体中形成精确细胞类型边界的机制。
Pre-cuticle DPY 6 acts as a blueprint for aECM periodic organization in C. elegans
该研究揭示了线虫中前角质蛋白 DPY-6 作为模具，通过其 C 端结构域指导胶原蛋白的周期性组装，从而在幼虫蜕皮过程中构建维持结构完整性和免疫稳态所需的周期性表皮细胞外基质。